Durante la guerra contra Pompeyo luchó en Hispania en la batalla de Ilerda, 49 a.C. Posteriormente la legión fue trasladada a Placentia. En la primavera de 48 a.C. sirvió en Dyrrhachium. Estuvo presente en Pharsalus, 9 de agosto de 48 a.C.

Después de esta batalla los soldados fueron enviados a Italia para recibir su pensión pero en el 46 la legión participó en la campaña africana de César. Algunos veteranos fueron instalados en Picenum, otro en Histria.

Octavio volvió a alistarla en el año 41 para enfrentarse a Sexto Pompeyo en Sicilia, pues su ocupación de la isla ponía en peligro el abastecimiento de grano a Roma. Una vez vencido Pompeyo, la legión fue enviada a los balcanes, donde recibió el sobrenombre de Macedónica.

Con el inicio de la guerra entre Octavio y Marco Antonio, la novena participó en la batalla de Actium y posteriormente fue enviada a la Hispania Tarraconensis, donde participó en las campañas de Octavio, ya Augusto, contra los cántabros, desde el 25 hasta el 13 a.C.

En esta campaña luchó junto a la I Germanica, la II Augusta, la IIII Macedonica, la V Alaude, la VI Victrix, la X Gemina, la XX Valeria Victrix y otra que quizás fuese la VIII Augusta.

Parece que la VIIII se distinguió especialmente en la campaña del año 24, momento en el que posiblemente recibió el sobrenombre de Hispana.

Es posible que algunas unidades de la legión fueran enviadas al Rhin el año 20 a.C. y participaran en la invasión de Germania por Agripa, al año siguiente, pero no está comprobado. Otra posibilidad es que estuvieran en las campañas de Druso en la orilla derecha del Rhin. No sabemos donde estaban ubicadas concretamente.

La legión fue trasladada a Panonia poco después de la desastrosa derrota del bosque de Teoteburgo en el año 9 d.C.

donde permaneció hasta el año 43 d.C. excepto por una expedición para ayudar a la III Augusta en su lucha contra los guerreros tribales de Tacfarinate en Mauretania (20-24 d.C.)

En el año 43 d.C. el emperador Claudio invade Britania con la II Augusta, la IX Hispana, la XIV Gemina y la XX Valeria Victrix. La novena fue estacionada en dos campamentos en Longthorpe y Newton-on-Trent.

Durante la revuelta de Boadicea algunas fuentes dicen quesufrió graves pérdidas, cercanas al 60% de sus efectivos. Pero dado que su comandante Quintus Petilius Cerialis siguió su carrera política normalmente, quizás el desastre no fue tan grave. De todas formas tenemos constancia del envío de refuerzos desde Germania.

En el año 65 d.C. la legión fue reagrupada en un campamento en Lincoln, pero seis años después fue transferida a York para proteger la frontera norte de Britania, reemplazando a la II Adiutrix.

Cerialis, que había vuelto a Britania después de una importante campaña en el Rhin contra una rebelión de los Batavos en el año 69, tomó de nuevo el mando de la VIIII Hispana y en el año 78 luchó contra Venucio, el líder de los Brigantes. Con la ayuda de la XX Valeria Victrix comandada por Gneo Julio Agricola, Venucio fue vencido cerca de Stanwick.

La última actuación de esta legión que podemos fechar con seguridad en Britania es la construcción de una fortaleza en York en el año 108.

No está claro lo que sucedió después de esto. Algunos investigadores sostienen que la legión fue destruída por los pictos en el año 117 o 118 d.C., lo que llevó al emperador Adriano a construir el famoso muro para proteger el Imperio de los ataques de los bárbaros del norte.

Pero al parecer, la legión o un destacamento de la misma estuvo destinado después del año 121 en Noviomago(Nijmegen), en la Germania Inferior. Al mismo tiempo la VI Victrix fue trasladada desde Germania Inferior a Britania, lo que hace pensar que pudo tratarse de un intercambio.

En una inscripción de la época de Marco Aurelio (161-180 d.C.) con la lista de las legiones, la VIIII no aparece, lo que hace pensar que fue destruída o desmovilizada antes de ese momento.

Por lo tanto pudo ser destruída en la revuelta judía de Simon Ben Kosiba 132-136, en Capadocia en 161 o en una revuelta en el Danubio en 162.

En las inscripciones conservadas se utiliza tanto la grafía IX como la VIIII, siendo más utilizada esta última.

Siendo una legión creada por Cesar, su animal totémico pudo ser el toro.